Муссонный, на большей части страны тропический, на северо-западе субтропический. Средние температуры января на равнине от +12 С до +16 С (в высокогорьях бывают морозы до -20 С), июля - от +30 С до +35 С. Осадков на равнинах выпадает 100 - 400 мм. в год, в горах - до 1000 мм. в год. Год в Пакистане делится на три сезона: прохладный (с октября по март), жаркий (с марта по июнь) и дождливый (с июля по сентябрь). С наступлением жаркого сезона на юге становится удушающе жарко и влажно, в северных районах в это время погода достаточно приятная. В горных районах погода напрямую зависит от высоты над уровнем моря и может сильно изменяться в течение суток.